Вода из родников и других источников нецентрализованного водоснабжения активно используется населением для питьевых и рекреационных целей, однако её микробиологическая безопасность не всегда гарантирована. Фекальное загрязнение таких вод представляет серьёзную эпидемиологическую угрозу, особенно в условиях расширения мегаполисов и нехватки качественной питьевой воды. В рамках исследования изучались родники, расположенные на территории города Ростова-на-Дону. Микробиологические показатели (E. coli, энтерококки, споры сульфитредуцирующих клостридий) анализировались с применением стандартных микробиологических методов и масс-спектрометрии MALDI TOF. Установлено, что 45,4% исследованных родников (10 из 22) соответствуют гигиеническим требованиям по трем микробиологическим показателям. Анализ полученных данных свидетельствует о том, что фекальное загрязнение родниковой воды в значительной степени обусловлено местоположением источника и наиболее выражено в районах, не оборудованных централизованной системой канализации.